Jupyter notebook上でのrpy2の設定方法
以下の環境下でのrpy2の設定方法について備忘録を残しておきます。
環境
- windows 10
- conad 23.1.0
- jupyter notebook 6.4.1
- rpy2 3.5.8
anaconda のインストール
詳細に関しては他のページをご参照ください。当ページでは省略します。
rpy2のインストール
condaからとpipからインストールする方法があります。condaからインストールするためには少し工夫が必要なので、ここではpipからインストールすることとします。
pip install rpy2
Rのインストール
詳細に関しては他のページをご参照ください。当ページでは省略します。
R_HOMEの環境変数の設定
rpy2が参照するRのシステムは、指定がない限り、環境変数R_HOMEになります。そのため、R_HOMEを設定する必要があります。R_HOMEはRをインストールした場所、デフォルトでは、
C:\Program Files\R\R-4.2.2
となっているはずです。
jupyter notebookでrpy2を使用してRを使用する
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陥りがちなエラー
- Rのライブラリが読み込めずエラー
原因: ライブラリの読み込み先が間違っている。
ライブラリをインストールする際に、anaconda経由でRのライブラリをインストールした。R_HOMEのPATHにライブラリがインストールされているか確認する。
